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Plateau d'imagerie cellulaire et tissulaire - UMR 3348 (Pict-IBiSA)

Keywords : microscopie plein champ, microscopie confocale, imagerie cellulaire, ImageJ

L'imagerie cellulaire et tissulaire est un domaine en pleine expansion qui vise à comprendre les mécanismes du vivant grâce à l'étude dynamique de la localisation de biomolécules au sein d'échantillons biologiques. Toutes nos méthodes reposent sur trois étapes majeures : la préparation des échantillons, l'acquisition d'images numériques, soit à fort niveau de détails (c'est-à-dire des images de cellules ou d'organelles intracellulaires), soit à basse résolution (c'est-à-dire des images d'organes ou d'organismes entiers), ainsi que l'analyse et le traitement d'images numériques.

La plate-forme « Imagerie cellulaire et tissulaire » à Orsay (PICT@Orsay) se situe au rez-de-chaussée des Laboratoires Raymond-Latarjet (bâtiment 112). Elle dispose d'un microscope plein champ pour l'acquisition d'images 3D d'échantillons fixés, (Fig 1 et 2).

Figure 1Figure 1 Figure 2Figure 2

Figure 1 : Division d'une cellule épithéliale rénale (lignée cellulaire rénale canine Madin-Darby) observée par microscopie à déconvolution en trois dimensions. Bleu : chromosomes ; vert : microtubules formant le fuseau mitotique ; rouge : sous-unité Arp1 du complexe dynéine/dynactine. Photo : Fabrice P. Cordelières.

Figure 2 : Cellule épithéliale interphasique (lignée HeLa) observée par microscopie en déconvolution 3D. Bleu : chromosomes ; vert : réticulum endoplasmique ; rouge : mitochondries. Photo : Fabrice P. Cordelières

Un vidéo-microscope 2D plein champ multi-positions, ainsi qu'un vidéo-microscope 4/5D plein champ (sur lequel les expériences de retour de fluorescence après photoblanchiment, FRAP, peuvent être réalisées) pour l'enregistrement des cellules vivantes, ainsi qu'un microscope confocal polyvalent pour les deux types d'observation d'échantillons. Trois ordinateurs mettent à la disposition de nos utilisateurs des logiciels commerciaux, ainsi que des logiciels développés en interne pour l'analyse et le traitement des images.

La plate-forme offre aux équipes de recherche à l'Institut Curie, ainsi qu'à celles des instituts voisins, un accès aux équipements de microscopie optique les plus innovants et les plus modernes, ainsi qu'à des installations de traitement des données post-acquisition dédiées. Notre personnel assure la formation de tous les utilisateurs. Cette formation est obligatoire pour pouvoir avoir accès aux installations.

Notre personnel organise régulièrement des cours et ateliers de formation au niveau national. A titre d'exemple, nous avons récemment organisé un cours sur « L'analyse et le traitement d'images sous ImageJ » dans le cadre des Tutoriaux nationaux technologiques en biophotonique. Nous intervenons également dans le cadre d'ateliers CNRS et Inserm (par exemple : Introduction à la vidéo-microscopie, Introduction à la microscopie confocale, Introduction à l'imagerie numérique, etc.).

PICT@Orsay entretient des relations étroites avec la communauté d'imagerie voisine, notamment avec le Centre de photonique biomédical d'Orsay et la Plate-forme d'Imagerie et de biologie cellulaire de Gif-sur-Yvette.